Семестровий курс "Комп'ютерне моделювання мультифізичних систем" є альтернативним курсом за вибором для курсу "Методи теоретичної фізики". У межах курсу розглядається підхід, у якому діють два типи механізмів і, відповідно, два типу теоретичного опису: континуальний опис шляхом розв'язання континуальних інтегро-диференціальних рівнянь масоперенесення під дією іонного бомбардування з колективною складовою і відповідне дифузійне наближення і класичне молекулярно-динамічне моделювання наноскопічних пікосекундних атомних каскадів зіткнень.  Таким чином, одночасно розглядаються два підхіда, які мають різні характерні довжини, часи та засоби та типи модельного представлення. Такий підхід до моделювання є поширеним і популярним у наш час, хоч і потребує значних витрат комп'ютерного часу для своєї реалізації.